Le zone umide sono un paradiso per le creature della fauna e della flora. In particolare, più di 350 tipi di piante crescono naturalmente nella palude di Senjogahara, che è anche famosa come luogo di osservazione tra gli amanti di birdwatching e non sono solo di uccelli selvatici. Il buon ambiente naturale di Nikko è anche la dimora di specie giapponesi di capricorni del Giappone, cervi del Giappone, ghiretti del Giappone, orsi tibetani, macachi giapponesi. Nei laghi si trovano salmoni rossi, trote iridee e trote fario per la gioia degli amanti della pesca.